rainclouds

Страница в процессе перевода.

# Makie.rainclouds — Function

rainclouds!(ax, category_labels, data_array; plot_boxplots=true, plot_clouds=true, kwargs...)

Строит график «скрипка» (гистограмму), коробчатую диаграмму и отдельные точки данных с соответствующим интервалом между ними.

Аргументы

ax: ось, на которой размещаются все эти графики.
category_labels: обычно Vector{String} с меткой для каждого элемента в data_array.
data_array: обычно вектор Vector{Float64}, представляющий точки данных для построения.

Именованные аргументы

Тип графика

Псевдоним типа графика для функции rainclouds — RainClouds.

Тучевые графики представляют собой сочетание (половины) скрипичного графика, коробчатого графика и графиков рассеяния. Все три вида вместе могут формировать привлекательный и информативный визуальный ряд, особенно для больших наборов данных N.

using CairoMakie
using Random
using Makie: rand_localized

####
#### Приведенные ниже данные используются для тестирования функционала построения графиков.
####

function mockup_distribution(N)
    all_possible_labels = ["Single Mode", "Double Mode", "Random Exp", "Uniform"]
    category_type = rand(all_possible_labels)

    if category_type == "Single Mode"
        random_mean = rand_localized(0, 8)
        random_spread_coef = rand_localized(0.3, 1)
        data_points = random_spread_coef*randn(N) .+ random_mean

    elseif category_type == "Double Mode"
        random_mean = rand_localized(0, 8)
        random_spread_coef = rand_localized(0.3, 1)
        data_points = random_spread_coef*randn(Int(round(N/2.0))) .+ random_mean

        random_mean = rand_localized(0, 8)
        random_spread_coef = rand_localized(0.3, 1)
        data_points = vcat(data_points, random_spread_coef*randn(Int(round(N/2.0))) .+ random_mean)

    elseif category_type == "Random Exp"
        data_points = randexp(N)

    elseif category_type == "Uniform"
        min = rand_localized(0, 4)
        max = min + rand_localized(0.5, 4)
        data_points = [rand_localized(min, max) for _ in 1:N]

    else
        error("Unidentified category.")
    end

    return data_points
end

function mockup_categories_and_data_array(num_categories; N = 500)
    category_labels = String[]
    data_array = Float64[]

    for category_label in string.(('A':'Z')[1:min(num_categories, end)])
        data_points = mockup_distribution(N)

        append!(category_labels, fill(category_label, N))
        append!(data_array, data_points)
    end
    return category_labels, data_array
end

category_labels, data_array = mockup_categories_and_data_array(3)

colors = Makie.wong_colors()
rainclouds(category_labels, data_array;
    axis = (; xlabel = "Categories of Distributions", ylabel = "Samples", title = "My Title"),
    plot_boxplots = false, cloud_width=0.5, clouds=hist, hist_bins=50,
    color = colors[indexin(category_labels, unique(category_labels))])

rainclouds(category_labels, data_array;
    axis = (; ylabel = "Categories of Distributions",
    xlabel = "Samples", title = "My Title"),
    orientation = :horizontal,
    plot_boxplots = true, cloud_width=0.5, clouds=hist,
    color = colors[indexin(category_labels, unique(category_labels))])

rainclouds(category_labels, data_array;
    axis = (;
        xlabel = "Categories of Distributions",
        ylabel = "Samples",
        title = "My Title"
    ),
    plot_boxplots = true, cloud_width=0.5, clouds=hist,
    color = colors[indexin(category_labels, unique(category_labels))])

rainclouds(category_labels, data_array;
    axis = (;
        xlabel = "Categories of Distributions",
        ylabel = "Samples",
        title = "My Title"
    ),
    plot_boxplots = true, cloud_width=0.5, side = :right,
    violin_limits = extrema, color = colors[indexin(category_labels, unique(category_labels))])

rainclouds(category_labels, data_array;
    axis = (;
        xlabel = "Categories of Distributions",
        ylabel = "Samples",
        title = "My Title",
    ),
    plot_boxplots = true, cloud_width=0.5, side = :right,
    color = colors[indexin(category_labels, unique(category_labels))])

more_category_labels, more_data_array = mockup_categories_and_data_array(6)

rainclouds(more_category_labels, more_data_array;
    axis = (;
        xlabel = "Categories of Distributions",
        ylabel = "Samples",
        title = "My Title",
    ),
    plot_boxplots = true, cloud_width=0.5,
    color = colors[indexin(more_category_labels, unique(more_category_labels))])

category_labels, data_array = mockup_categories_and_data_array(6)
rainclouds(category_labels, data_array;
    axis = (;
        xlabel = "Categories of Distributions",
        ylabel = "Samples",
        title = "My Title",
    ),
    plot_boxplots = true, cloud_width=0.5,
    color = colors[indexin(category_labels, unique(category_labels))])

4 из них, между 3 распределениями Левый и правый пример С коробчатым графиком и без него

fig = Figure(size = (800*2, 600*5))
colors = [Makie.wong_colors(); Makie.wong_colors()]

category_labels, data_array = mockup_categories_and_data_array(3)
rainclouds!(
    Axis(fig[1, 1], title = "Left Side, with Box Plot"),
    category_labels, data_array;
    side = :left,
    plot_boxplots = true,
    color = colors[indexin(category_labels, unique(category_labels))])

rainclouds!(
    Axis(fig[2, 1], title = "Left Side, without Box Plot"),
    category_labels, data_array;
    side = :left,
    plot_boxplots = false,
    color = colors[indexin(category_labels, unique(category_labels))])

rainclouds!(
    Axis(fig[1, 2], title = "Right Side, with Box Plot"),
    category_labels, data_array;
    side = :right,
    plot_boxplots = true,
    color = colors[indexin(category_labels, unique(category_labels))])

rainclouds!(
    Axis(fig[2, 2], title = "Right Side, without Box Plot"),
    category_labels, data_array;
    side = :right,
    plot_boxplots = false,
    color = colors[indexin(category_labels, unique(category_labels))])

# Графики с дополнительными категориями
# dist_between_categories (0.6, 1.0)
# с тучами и без них

category_labels, data_array = mockup_categories_and_data_array(12)
rainclouds!(
    Axis(fig[3, 1:2], title = "More categories. Default spacing."),
    category_labels, data_array;
    plot_boxplots = true,
    gap = 1.0,
    color = colors[indexin(category_labels, unique(category_labels))])

rainclouds!(
    Axis(fig[4, 1:2], title = "More categories. Adjust space. (smaller cloud widths and smaller category distances)"),
    category_labels, data_array;
    plot_boxplots = true,
    cloud_width = 0.3,
    gap = 0.5,
    color = colors[indexin(category_labels, unique(category_labels))])

rainclouds!(
    Axis(fig[5, 1:2], title = "More categories. Adjust space. No clouds."),
    category_labels, data_array;
    plot_boxplots = true,
    clouds = nothing,
    gap = 0.5,
    color = colors[indexin(category_labels, unique(category_labels))])

supertitle = Label(fig[0, :], "Cloud Plot Testing (Scatter, Violin, Boxplot)", fontsize=30)
fig

Атрибуты

boxplot_nudge

Значение по умолчанию: 0.075
определяет расстояние, на котором коробчатая диаграмма должна находиться от центральной линии, когда center_boxplot имеет значение false. Это значение, используемое для изменения центра коробчатой диаграммы.

boxplot_width

Значение по умолчанию: 0.1
ширина коробчатой диаграммы по оси категорий.

center_boxplot

Значение по умолчанию: true
следует ли центрировать коробчатую диаграмму по оси категорий.

cloud_width

Значение по умолчанию: 0.75
определяет размер графика «скрипка». Соответствует именованному аргументу width в violin.

clouds

Значение по умолчанию: violin
[violin, hist, nothing] как отображать облачные графики: в виде графиков «скрипка», гистограмм или не отображать вообще.

color

Значение по умолчанию: @inherit patchcolor
один цвет или вектор цветов, по одному для каждой точки.

cycle

Значение по умолчанию: [:color => :patchcolor]
документация недоступна.

dodge

Значение по умолчанию: automatic
вектор из Integer (длина данных) группирующих переменных для создания нескольких расположенных рядом коробок в одной позиции x.

dodge_gap

Значение по умолчанию: 0.01
расстояние между расположенными рядом коробками.

gap

Значение по умолчанию: 0.2
расстояние между элементами на главной оси (в зависимости от orientation).

hist_bins

Значение по умолчанию: 30
при значении clouds=hist в вызов гистограммы передается количество столбцов.

jitter_width

Значение по умолчанию: 0.05
определяет ширину столбца диаграммы рассеяния по оси категорий x в абсолютной форме.

markersize

Значение по умолчанию: 2.0
размер маркера для диаграммы рассеяния.

n_dodge

Значение по умолчанию: automatic
количество отображаемых рядом друг с другом категорий (по умолчанию maximum(dodge)).

orientation

Значение по умолчанию: :vertical
ориентация rainclouds (:vertical или :horizontal).

plot_boxplots

Значение по умолчанию: true
следует ли отображать коробчатые диаграммы для обобщения распределения данных.

show_boxplot_outliers

Значение по умолчанию: false
отображать выбросы на коробчатой диаграмме в виде точек (обычно в сочетании с диаграммой рассеяния это может сбивать с толку, поэтому по умолчанию выбросы не отображаются).

show_median

Значение по умолчанию: true
определяет, следует ли отображать линию для медианного значения на коробчатой диаграмме.

side

Значение по умолчанию: :left
может принимать значения :left и :right; определяет, где будет располагаться график «скрипка» относительно точек рассеяния.

side_nudge

Значение по умолчанию: automatic
относится к графику рассеяния. Значение по умолчанию — 0,02, если plot_boxplots имеет значение true; в противном случае по умолчанию 0.075.

strokewidth

Значение по умолчанию: 1.0
определяет ширину штрихов контура коробчатой диаграммы.

violin_limits

Значение по умолчанию: (-Inf, Inf)
задает значения для обрезки violin. Может иметь тип Tuple или Function (например, datalimits=extrema)

whiskerwidth

Значение по умолчанию: 0.5
ширина усов Q1, Q3 на коробчатой диаграмме. Значение задается как доля от boxplot_width.